空间转录组是指从一个完整的组织样本中获得全部的转录组数据,并且能够从时间和空间上反应组织在特定区域的表达情况。是一项突破性的技术,弥补了传统单细胞转录组测序所不能体现的位置信息,对于RNA转录后水平的调控具有重要意义,对细胞功能的探究提供了更加精确的依据,对于理解疾病病理学也至关重要。广泛应用于肿瘤研究、免疫研究、发育生物学、脑神经学、病理学等领域。
技术原理
对新鲜冷冻组织进行切片并放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上,进行固定、染色和透化,促使细胞中的mRNA释放,mRNA从组织的近端位置结合捕获寡核苷酸,以捕获的RNA为模板进行cDNA合成,构建文库并进行测序,最后进行可视化分析。
空间转录组实验流程
技术优势
对多种样本的完整组织切片实现无偏且高通量的基因表达分析
分析同一组织切片的组织学和mRNA图谱,发现新的组织标志物
揭示生物学结构,并了解局部细胞在正常组织和患病组织中如何相互作用
在开展基因表达研究时不再需要解离样本
表征细胞群体,而无需预先了解细胞亚型或细胞标志物
分析和了解基因表达异质性以及这对生物系统有何贡献
通过增加基因表达信息来确认、鉴定或排除形态学结论
应用方向
肿瘤异质性
组织形态学
宿主移植反应
组织发育机制
治疗干预反应
生物标志物发现
细胞图谱
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2020-02
2020年2月4日,中共中央政治局常委、国务院总理、中央应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组组长李克强主持召开领导小组会议。会议指出,要提高检测确诊能力,缩短检测时间,从全国疾控系统调派检测力量支援武汉,允许符合条件的第三方检测机构开展核酸检测。2月5日,中科普瑞积极响应参与… [了解更多]
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