近年来,蛋白质作为生命活动的功能执行体,其研究价值越来越受到重视,将蛋白组学和基因组学研究结合在一起进行多维度单细胞信息解读,不仅能够更好地观察细胞之间的异质性,同时也能够更清楚地识别特定细胞及其功能。BD Abseq 与BD RhapsodyTM 高通量单细胞捕获系统结合使用的方式,能够使研究人员同时分析数千个单细胞中的 RNA 和蛋白质,完整揭示出生物学系统中基因和蛋白质的作用。
AbSeq是利用特异性抗体核酸偶联结构,将蛋白表达量转化为核酸含量,然后通过高通量测序手段检测蛋白含量。
抗体核酸偶联结构图
技术流程
BD Rhapsody™融合了 WTA 和 Abseq 两种单细胞检测技术,将蛋白组和转录组的检测过程在单细胞水平很好地进行了融合。细胞经过 BD AbSeq Ab-oligos 标记后,通过 BD Rhapsody™ 微孔沉降技术捕获单细胞全转录组 mRNA 和 Ab-oligo。然后,利用文库扩增试剂对同一样本产生平行的 RNA 和 BD AbSeq 测序文库。经过高通量测序后获得 RNA 和蛋白表达的数据,并使用特定分析软件 SeqGeqTM 进行数据分析。
实验技术流程图
技术优势
可对同一个样本,在一次实验中得到高通量mRNA 和 蛋白表达量数据
蛋白的表达量数据可弥补mRNA中不能检测到的信息
依据蛋白的表达量数据更加准确可靠的鉴定细胞亚群
应用方向
肿瘤异质性
组织发育机制
治疗干预反应
生物标志物发现
抗体列表
目前 BD 公司推出的 Abseq 抗体约有400余种(人和小鼠),可以满足大部分实验需求。部分列表如下(如需全部抗体目录,请咨询中科普瑞当地销售人员)。
Calalog No. | Product Description | Specificity |
940000 | Hu CD3 Ab-O AHS0033 SK7 25Tst | CD3 |
940001 | Hu CD4 Ab-O AHS0032 SK3 25Tst | CD4 |
940002 | Hu CD45 Ab-O AHS0040 HI30 25Tst | CD45 |
940003 | Hu CD8 Ab-O AHS0027 RPA-T8 25Tst | CD8 |
940004 | Hu CD19 Ab-O AHS0030 SJ25C1 25Tst | CD19 |
940005 | Hu CD14 Ab-O AHS0037 MPHIP9 25Tst | CD14 |
940006 | Hu CD16 Ab-O AHS0053 3G8 25Tst | CD16 |
940007 | Hu CD56 Ab-O AHS0019 NCAM16.2 25Tst | CD56 |
940008 | Hu CD11b Ab-O AHS0005 M1/70 25Tst | CD11b |
940009 | Hu CD25 Ab-O AHS0026 2A3 25Tst | CD25 |
940010 | Hu HLA-DR Ab-O AHS0035 G46-6 25Tst | HLA-DR |
940011 | Hu CD45RA Ab-O AHS0009 HI100 25Tst | CD45RA |
940012 | Hu CD127 Ab-O AHS0028 HIL-7R-M21 25Tst | CD127 |
940013 | Hu CD38 Ab-O AHS0022 HIT2 25Tst | CD38 |
940014 | Hu CD197 Ab-O AHS0007 3D12 25Tst | CD197 |
940015 | Hu CD279 Ab-O AHS0014 EH12.1 25Tst | CD279 |
940016 | Hu CD20 Ab-O AHS0008 2H7 25Tst | CD20 |
940017 | Hu CD28 Ab-O AHS0024 CD28.2 25Tst | CD28 |
940018 | Hu CD27 Ab-O AHS0025 M-T271 25Tst | CD27 |
940019 | Hu CD69 Ab-O AHS0010 FN50 25Tst | CD69 |
940020 | Hu CD123 Ab-O AHS0020 7G3 25Tst | CD123 |
940021 | Hu CD34 Ab-O AHS0061 581 25Tst | CD34 |
940022 | Hu CD45RO Ab-O AHS0036 UCHL1 25Tst | CD45RO |
940024 | Hu CD11c Ab-O AHS0056 B-LY6 25Tst | CD11c |
940025 | Hu CD86 Ab-O AHS0057 2331 (FUN-1) 25Tst | CD86 |
940026 | Hu IgD Ab-O AHS0058 IA6-2 25Tst | IgD |
940027 | Hu IgG Ab-O AHS0059 G18-145 25Tst | IgG |
940028 | Hu CD24 Ab-O AHS0042 ML5 25Tst | CD24 |
940029 | Hu CD7 Ab-O AHS0043 M-T701 25Tst | CD7 |
940030 | Hu CD183 Ab-O AHS0031 1C6/CXCR3 25Tst | CD183 |
940031 | Hu CD33 Ab-O AHS0044 WM53 25Tst | CD33 |
940032 | Hu CD90 Ab-O AHS0045 5E10 25Tst | CD90 |
940033 | Hu CD196 (CCR6) Ab-O AHS0034 11A9 25Tst | CD196 (CCR6) |
940034 | Hu CD152 Ab-O AHS0017 BNI3 25Tst | CD152 |
940035 | Hu CD274 Ab-O AHS0004 MIH1 25Tst | CD274 |
940036 | Hu CD80 Ab-O AHS0046 L307.4 25Tst | CD80 |
940037 | Hu CD95 Ab-O AHS0023 DX2 25Tst | CD95 |
结果展示
单细胞水平上蛋白质与基因表达的相关性图
覆盖两种蛋白标记物(CD4 和 CD45RA)的t-SNE 分析表达热图
2020-02
2020年2月4日,中共中央政治局常委、国务院总理、中央应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组组长李克强主持召开领导小组会议。会议指出,要提高检测确诊能力,缩短检测时间,从全国疾控系统调派检测力量支援武汉,允许符合条件的第三方检测机构开展核酸检测。2月5日,中科普瑞积极响应参与… [了解更多]
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