簇生成和测序
| MiSeq Reagent Kit v2 | MiSeq Reagent Kit v3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 读长 | 1 × 36 bp | 2 × 25 bp | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 75 bp | 2 × 300 bp |
| 总时间* | ~4小时 | ~5.5小时 | ~24 小时 | ~39小时 | ~21小时 | ~56小时 |
| 产出 | 540–610 Mb | 750–850 Mb | 4.5–5.1 Gb | 7.5–8.5 Gb | 3.3–3.8 Gb | 13.2–15 Gb |
| MiSeq Reagent Kit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | ||
|---|---|---|---|
| 读长 | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 150 bp |
| 总时间* | ~19小时 | ~28小时 | ~17小时 |
| 产出 | 1.2 Mb | 500 Mb | 300 Mb |
* 总时间包括MiSeq系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。
通过过滤的read**
| MiSeq Reagent Kit v2 | MiSeq Reagent Kit v3 | MiSeq Reagent Kit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | |
|---|---|---|---|---|
| 单端Read | 12–15 million | 22–25 million | 4 million | 1 million |
| 双端Read | 24–30 million | 44–50 million | 8 million | 2 million |
** 安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库 (对于V2版本，通过过滤的簇密度是865-965 k/mm2 ；对于V3版本，通过的簇密度是 1200-1400 k/mm2 )。根据样本类型、样本质量、通过过滤的簇的不同，真实的性能参数可能有所差异。
质量值†
| MiSeq Reagent Kit v2 | MiSeq Reagent Kit v3 |
|---|---|
| 在1 × 36 bp时，> 90%的碱基高于Q30 | 在2 × 75 bp时，> 85%的碱基高于Q30 |
| 在2 × 25 bp时，> 90%的碱基高于Q30 | 在2 × 300 bp时，> 70%的碱基高于Q30 |
| 在2 × 150 bp时，> 80%的碱基高于Q30 | |
| 在2 × 250 bp时，> 75%的碱基高于Q30 |
† 总时间包括NextSeq 500系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。
