ATAC-seq测序全称为Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing，是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf、Jason Buenrostro和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放性）的方法，原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性，然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。

我们每个人体细胞含有两米长的DNA，紧密地包裹在微观核中。ATAC-seq可识别DNA的哪些部分被解开，从而能有蛋白接近进行调控。基因受许多不同的蛋白质调控。例如，转录因子与DNA结合，并进行读取。有无数的转录因子，每一个都识别并结合非常特异的DNA序列。该序列称为motif，因为它非常具有特异性，所以可以在ATAC-seq数据中进行标记。该技术广泛的应用于基因组学界，例如人类细胞图谱项目，用于理解和绘制基因组功能。但是其复杂的过程耗时且效率低，只有一小部分细胞能产生可靠的结果。

ATAC-seq可一次性得到整个基因组上的开放染色质图谱，可用于探究转录因子结合，基因表达调控等生物学过程。比较发育不同阶段、不同实验条件下开放染色质图谱的变化，可进一步探究特定的生物学机制，比如胚胎发育的不同阶段，肿瘤相对正常组织开放染色质图谱的变化等等。

技术优势

超高通量:每个通道可容纳5000~10000个细胞核

超强捕获：细胞核捕获率高达65%

适用广泛：适用于细胞系、原代细胞、新鲜和冻存样本的研究

精细分析：可对单细胞基因调控网络进行精细化分析

应用方向

研究细胞异质性

探索生物标志物

定义细胞类型

构建基因调控网络