RNA pull-down是研究细胞内RNA与蛋白或与RNA结合情况的技术。通过将RNA进行标记（生物素探针），再与细胞裂解液共同孵育，从而形成RNA-蛋白质复/RNA合物，之后再分离复合物得到蛋白质/RNA。通过western blot 或mass Spectrometry检测蛋白质，通过定量PCR或高通量测序来鉴定与其相互作用的RNA分子。RNA pull-down已成为研究RNA与蛋白互作的核心技术。

实验方案

目标RNA的制备及生物素标记 — 磁珠富集RNA — RNA结合蛋白孵育 — RNA结合蛋白洗脱 — 银染质检 — WB/MS检测

交付内容

✔  完整的实验报告

✔  提供RNA pull down 产物Western Blot及质谱鉴定结果

技术优势

✔ 富集检测低丰度目的蛋白-RNA复合物；

✔ 与RIP结果可进行相互验证。

样本量要求

✔  细胞样本＞1*10⁸；

✔  组织 >500mg。

案例分享

题目：Dendritic Cell Differentiation The STAT3-Binding Long Noncoding RNA lnc-DC Controls Human

本文章主要探究lncRNA在树突细胞（dendritic cell，DC）分化及功能中的作用。作者发现了一个关键的lncRNA（lnc-DC）。机制研究利用RNA pull down联合MS发现lnc-DC与STAT3（转录因子）相互作用，进一步用RIP实验反向验证STAT3可与lnc-DC结合。本研究表明，lnc-DC与细胞质中的STAT3结合，阻止了SHP1对STAT3的去磷酸化，增强了STAT3的信号通路，通过调节翻译后修饰来影响细胞分化和功能。