传统的RNA-Seq方法通过分析整个细胞群体的RNA,能得到的仅仅是一个整体检测的平均值,并不能代表每个单细胞的转录组。通过每次分析单个细胞的转录组,可以捕获样品中的异质性,并从生物体的基本单位 — 细胞上进行研究。
单细胞RNA-seq的基本流程如下:①从组织分裂得到单细胞悬液;②分离单个细胞;③捕获并扩增细胞内RNA;④构建测序文库并测序。
单细胞RNA-seq基本流程图
应用方向
大规模细胞图谱构建
细胞亚群细化&稀有细胞类型鉴定
肿瘤方向研究
干细胞发育及分化研究
免疫方向研究
发育生物学
生物标志物/疾病分型
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中科普瑞单细胞平台介绍—10X Genomics单细胞转录组测序服务
10X Genomics的Chromium系统利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞和转录本,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可实现数千甚至数万个单细胞群体分析,解决常规scRNA-seq方法在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓新的思路。
技术流程
将样本分配到100,000s到1000,000s微反应体系,每个微反应体系含有一种特定的DNA序列标记。
含有barcode信息的凝胶珠子首先与样品和酶的混合物混合,然后与位于微流体“双十字”连接中的油表面活性剂溶液结合。
GEMs (包含样品、酶、凝胶珠子的混合物油滴)流到储液器中并进行收集。凝胶珠子溶解释放barcode序列,开始对样本进行标记。将每个液滴中含有barcode信息的产物混合。然后构建标准测序文库。
服务优势
灵活的细胞选取范围:每个样本可检测细胞数范围为1000-9000个。
超高的细胞捕获效率:单个样本细胞捕获率高达65%,高效获取每个细胞的基因表达信息。
应用于各层面研究:可成功应用于识别细胞周期、肿瘤细胞异质性、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分型、疾病分型等领域。
样本酶解和组织保存解决方案:中科普瑞在近两年的单细胞服务中积累了丰富的经验,为您的单细胞研究服务保驾护航。
样本要求
类型: 新鲜组织,原代细胞,细胞系等。
来源: 血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。
专注组学 精准定位 用心服务 帮您实现科研价值
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