文章题目:Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Epithelial Cell Signatureof Multiple Subtypes in Chemically Induced Acute Lung Injury
发表期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
影响因子:IF=6.208
合作单位:复旦大学附属金山医院
样本类型:肺泡灌洗液
一、研究背景和目的
肺泡上皮细胞(AECs)在化学诱导的急性肺损伤(CALI)中发挥作用。本文以光气诱导的CALI大鼠模型中的上皮细胞类型和状态探究诱导肺泡上皮2型细胞(AEC2s)增殖、退出细胞周期并转分化为肺泡上皮1型细胞(AEC1s)的机制。
二、检测手段
10× Genomics scRNAseq
三、研究结论
对光气诱导的CALI大鼠模型(Gas)和正常对照组(NC)的支气管肺泡灌洗液(BALF)样本进行单细胞RNA测序。从NC和Gas BALF样品中,分别提取了37245和29853个优质细胞。所有的细胞类型和状态都被鉴定并分为23个簇;鉴定出三种细胞类型:巨噬细胞、上皮细胞和巨噬细胞增殖细胞。从NC和Gas样品中分别提取1315个和1756个上皮细胞,并分为11个簇。吸入光气后,AEC1s的数量显著减少。一种独特的SOX9阳性的AEC2细胞类型,在CALI状态下显著扩增。这种祖细胞类型可发展成肺泡细胞,表明其具有干细胞分化的潜力。
四、部分结果展示
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