Illumina NovaSeq 6000 测序平台

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每个流动槽的序列产出

 NovaSeq 5000与6000系统NovaSeq 6000系统
流动槽类型eS1*S2S3*S4*
2 x 50 bp高达167 Gb280–333 GbNA**NA**
2 × 100 bp高达333 Gb560–667 GbNA**NA**
2 × 150 bp高达500 Gb850–1000 Gb高达2000 Gb高达3000 Gb

参数基于Illumina PhiX 标准文库支持簇密度下数据产出的情况。

* The NovaSeq 5000系统,NovaSeq 5000系统Upgrade以及包含 S1,S3或S4流动槽的NovaSeq Reagent Kits将会在2017年提供。

** NA: not applicable

Reads Passing Filter

 NovaSeq 5000与6000系统NovaSeq 6000系统
流动槽类型S1*S2S3*S4*
 高达1.6 B2.8–3.3 B高达6.6 B高达10 B

质量分值 与运行时间††

 NovaSeq 6000系统
流动槽类型S2
Read长度2 x 50 bp2 × 100 bp2 × 150 bp
质量分值 (percent of bases above Q30)≥ 85 %≥ 80 %≥ 75 %
运行时间19 小时29 小时40 小时

† 质量分值 (Q-score) 是对碱基检出中错误发生几率的预测。 bases > Q30 的百分比为整个运行中数据的平均值。

†† 运行时间包括在NovaSeq 6000系统上进行簇生成、测序以及运行双S2流动槽进行碱基读取的时间。

对关键应用估计的样品通量†††

 NovaSeq 5000与6000系统NovaSeq 6000系统
流动槽类型S1*S2S3*S4*
每次运行的人类基因组数n多达8个多达16个多达32个多达48个
每次运行的外显子数多达66个多达132个

每次运行的转录组数多达66个多达132个

††† 所有的样品通量是基于双流动槽运行的估计值。人类基因组假设每个样品能够生成 > 120 Gb的数据,从而实现30x的基因组覆盖度。外显子假设以 ≥ 2 x 75 bp生成 ≥ 50M的reads。转录组假设以 ≥ 2 x 50 bp生成 ≥ 50M的reads。


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