þ ChIP-SEQ

通过染色质免疫沉淀（ChIP）检测和测序技术相结合，ChIP测序（ChIP-Seq）成为鉴定转录因子及其他蛋白因子在全基因组范围内的DNA结合位点的强有力方法。在ChIP操作之后，通过特异抗体将DNA结合蛋白免疫沉淀。结合的DNA被同时沉淀、纯化并测序。新一代测序（NGS）在ChIP上的应用已经揭示了一些在各种疾病和生物学通路（如发育和癌症发展）中发挥作用的基因调控事件的线索。ChIP-Seq能够在全基因组规模上实现对蛋白与核酸相互作用的全面检测。

• 可在任何生物体的整个基因组中捕获转录因子或组蛋白修饰的DNA靶点

• 确定转录因子的结合位点

• 结合RNA测序和甲基化分析，揭示基因调控网络

• 可兼容不同起始量的DNA样品

ChIP-Seq可鉴定DNA结合蛋白的结合位点，可用于定位一个给定蛋白的整体结合位点。芯片及其他研究表观基因组的方法往往有着内在的偏向性，因为它们需要来自已知序列的探针，ChIP-Seq则不同，不需要任何先验知识。ChIP-Seq通过大规模并行测序提供全基因组的图谱，产生覆盖多个样品的数百万次计数分析，实现经济且精确的分析。