þ 大鼠/小鼠DNA甲基化捕获测序
SureSelectXT甲基化测序系统（Methyl-Seq）是一个全面的NGS靶向序列捕获系统。除研究人以外，该系统可以对大鼠、小鼠两种常见模式动物进行表观遗传学检测，帮助研究者寻找那些已知甲基化可影响基因调控的区域：CpG islands、CpG island shores、CpG island shelves、 undermethylated 区域、启动子及差异性甲基化区域 (DMR)。
技术优势
l 小鼠约100 Mb区域设计CpG，大鼠90 Mb区域设计CpG
l 高灵敏度：单碱基分辨率
l 高端的生信分析平台：中科普瑞开发的表观云分析工具
l 不依赖甲基化状态的探针
l 高灵敏度：分辨率可达到单个碱基
l 成本低：相比全基因组重亚硫酸盐测序，可提高通量并降低成本
l 与现有甲基化方法相比，可降低偏差（bias）
技术流程
图1. SureSelectXT甲基化测序系统工作流程经过优化，用于采用 Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统进行 DNA 甲基化分析
数据分析
利用中科普瑞开发的表观云分析工具分析 DNA 甲基化，可简单快速实现甲基化水平、CpG 区域覆盖和碱基质量等的可视化。通过单碱基对分辨率鉴定甲基化状态，可以发现 DMR的基因，既能实现甲基化与转录、WES等的关联分析，又能实现对重要甲基化区域的鉴定与生物学功能挖掘。
图2. 表观星云平台。
图3. 表观云平台的捕获测序预处理结果数据指控图。
图4. 生物信息分析流程图，红色标注为中科普瑞特色分析内容
